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nr,nt,swissprot,cog,kegg是什么意思?

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NR文库属于非重叠蛋白质序列数据库,是NCBI蛋白质序列的官方数据库。数据来自GenPept,SwissProt,PIR,PDF,PDB和NCBIRefSeq。这是默认的蛋白质比对数据库。
NT数据库是来自国家生物技术信息中心的NCBI核酸序列的官方数据库。NT文库属于非重叠核酸序列的数据库。数据来自GenBank,EMBL和DDBJ。
SwissProt数据库是一个带注释的蛋白质数据库,手动注释,将Unigene注释到SwissProt数据库,以获得更高质量的注释结果。
COG(簇正交组)主要是原核生物和单细胞真核生物的直向同源物。KOG数据库(clusterofeu KaryoticOrtholog Groups)包含来自真核直系同源家族的七种完整蛋白质的基因组,构成每种KOG的蛋白质组是系统发育上分类的祖先蛋白质,通常通过似乎源自COG的原核生物,KOG代表真核生物,KOG和COG提供类似的基因同源物的分类信息。
KEGG(京都基因和基因组百科全书)是一个综合数据库,用于处理基因组,生物途径,疾病,药物和化学联合。
类似的KEGG生物信息,包括来自其他基因组的数据,用于药物发现的代谢组学分析(药物发现),细胞过程(细胞内处理),环境信息处理(环境信息处理),遗传信息处理(处理)遗传信息),人类疾病(人类疾病),代谢(Metabolism),OrganismalSystems(有机系统)等。
GO(基因本体论):基因本体论。
生物技术发展迅速,数据不断增长,各种数据库名称标准也不统一。为了解决不同生物数据库可以使用不同术语的问题,Gene Onoline Consortium开发GO并描述细胞,组织和组织水平的分子功能表达内的基因。
GO的基本解释单元是GOterms。
GO主要由三个方面组成:生物过程,分子功能和细胞成分。这些用于解释基因产物的功能。
GO使用三种交互:is_a,part_of和regula。